ইসলামী ছাত্রশিবিরের প্রাইভেট ইউনিভার্সিটি শাখা দুই ভাগে ভাগ করা হয়েছে। প্রাইভেট ইউনিভার্সিটি পূর্ব (সদস্য শাখা) ও পশ্চিম (সাথী শাখা )নামে ভাগ করে চলতি ২০২৫ সেশনের বাকি সময়ের জন্য নতুন নেতৃত্ব নির্বাচন এবং মনোনয়ন সম্পন্ন হয়েছে।
রোববার সংগঠনটি জানিয়েছে, প্রাইভেট ইউনিভার্সিটি পূর্ব (সদস্য শাখা) শাখার আওতায় থাকছে উত্তরা, খিলক্ষেত, বসুন্ধরা, ভাটারা, গুলশান, রামপুরা, পূর্বাচল, মহাখালী অঞ্চলের ইউনিভার্সিটি। এ শাখার সভাপতি হলেন-জাহিদুল ইসলাম (বর্তমান সভাপতি)। সেক্রেটারি হয়েছেন আশরাফুল হাসান জায়েদ (শাখা বিএম সম্পাদক)
অন্যদিকে প্রাইভেট ইউনিভার্সিটি পশ্চিম (সাথী শাখা) শাখার আওতায় রয়েছে আশুলিয়া, মানারাত, সিটি, ডেফোডিল, মিরপুর, ধানমন্ডি, ফার্মগেট এলাকার ইউনিভার্সিটি। এই শাখার সভাপতি হয়েছেন রেজাউল করিম (সাবেক শাখা সেক্রেটারি, প্রাইভেট ইউনিভার্সিটি) এবং সেক্রেটারি হয়েছেন শান্ত তালুকদার (সাবেক শাখা অফিস সম্পাদক)।